ベストウエスタンホテル・イエナのスパ施設については、宿泊客から賛否両論の評価が寄せられています。サウナは心地よくて魅力的だと感じた人もいる一方で、いくつかの欠点を指摘する声もありました。スパルームは古く、狭く、メンテナンスが必要だと評されることが多く、アメニティの利用可能性も問題で、サウナエリアが閉鎖されていたり、十分な設備がなかったり、プールがメンテナンス中であったりする事例が複数ありました。ウェルネスとフィットネスセンターのサービスは、実際には機能が限られており、ほとんどが机上の空論であると指摘する宿泊客もいました。肯定的な言及もたまにあるものの、全体的な意見としては、スパの潜在能力が十分に発揮されておらず、宿泊客の期待に応えるためには改善が必要であるという意見が多いようです。